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Microbiote intestinal et Covid-19 : des perspectives prometteuses


La recherche se mobilise pour accélérer la production des connaissances sur le SARS-Cov-2, et sur la maladie qu’il provoque (Covid-19), ainsi que sur les moyens de la prévenir et de la guérir. Elle apparaît d'ores et déjà comme une maladie virale aux multiples visages. 


Alors que la plupart des personnes touchées ressentent un mal de gorge, de la fièvre et des difficultés respiratoires, plusieurs études révèlent aussi la présence de signes digestifs (diarrhées, nausées, vomissements ou douleurs abdominales) chez les personnes atteintes.(1) (2)


Différentes hypothèses sont avancées pour expliquer comment le SARS-Covid-2 pourrait induire ces manifestations digestives. 


La perturbation du microbiote intestinal apparaît comme un des facteurs clés. Effectivement, la plupart des symptômes digestifs décrits sont souvent corrélés au déséquilibre du microbiote intestinal.  


Pour comprendre les liens entre Covid-19 et microbiote intestinal il faut s’intéresser à l’importance de l’axe intestin-poumon. Le microbiote intestinal est précurseur du microbiote pulmonaire et aurait une action à distance sur l’écosystème pulmonaire (3). 


L’effet protecteur du microbiote digestif est reconnu dans les infections respiratoires. En effet, la restauration de la flore intestinale de souris axéniques (sans germes) présentant une susceptibilité accrue aux infections a améliorer la défense anti-bactérienne des poumons (4).


Toute dysbiose intestinale aurait des répercussions sur l’homéostasie pulmonaire. 


La restauration du microbiote intestinal semble être un levier d’action prometteur pour restaurer la santé respiratoire (5), tout particulièrement au travers de l’utilisation des probiotiques (6). 




  1. Song, Y., Liu, P., Shi, X. L., Chu, Y. L., Zhang, J., Xia, J., ... & Wang, M. Y. (2020). SARS-CoV-2 induced diarrhoea as onset symptom in patient with COVID-19. Gut.

  2. Guan, W. J., Ni, Z. Y., Hu, Y., Liang, W. H., Ou, C. Q., He, J. X., ... & Du, B. (2020). Clinical characteristics of coronavirus disease 2019 in China. New England Journal of Medicine.

  3. Revue Microbiote-12 microbiote pulmonaire

  4. Samuelson, D. R., Welsh, D. A., & Shellito, J. E. (2015). Regulation of lung immunity and host defense by the intestinal microbiota. Frontiers in microbiology, 6, 1085.

  5. Trompette, A., Gollwitzer, E. S., Yadava, K., Sichelstiel, A. K., Sprenger, N., Ngom-Bru, C., ... & Marsland, B. J. (2014). Gut microbiota metabolism of dietary fiber influences allergic airway disease and hematopoiesis. Nature medicine, 20(2), 159.

  6. Holt PG. The mechanism or mechanisms driving atopic asthma initiation: The infant respiratory microbiome moves to center stage. J Allergy Clin Immunol. 2015;136:15–22. 

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